کلسترول عمدتاً در مواد غذایی حیوانی وجود دارد. از آن‌جا که کره‌ی کاکائو منشاء گیاهی دارد، میزان کلسترول آن بسیار ناچیز است. بنابراین، شکلات تلخ تقریباً فاقد کلسترول است و در هر ۱۰۰ گرم کمتر از ۵ میلی‌گرم کلسترول دارد. شکلات شیری و سفید به دلیل وجود شیرخشک، اندکی کلسترول بیشتری دارند؛ به‌طور میانگین، شکلات شیری حدود ۱۵ میلی‌گرم و شکلات سفید حدود ۲۰ میلی‌گرم کلسترول در هر ۱۰۰ گرم دارد. برای مقایسه، تخم‌مرغ در هر ۱۰۰ گرم حدود ۳۸۰ میلی‌گرم کلسترول دارد.
علاوه بر این، تحقیقات جدید نشان می‌دهند که کلسترول موجود در مواد غذایی تأثیر چندانی بر میزان کلسترول خون ندارد. به همین دلیل، در آخرین دستورالعمل‌های تغذیه‌ای ایالات متحده، کلسترول دیگر جزو مواد مغذی نگران‌کننده طبقه‌بندی نمی‌شود.