باید میان اولین استفاده از کاکائوی طبیعی (وحشی) و کاکائوی کشت‌شده تفاوت قائل شویم.

قدیمی‌ترین نشانه‌ی شناخته‌شده از استفاده‌ی انسان از کاکائو به ۵۵۰۰ سال پیش بازمی‌گردد. این کشف در روستایی به نام لا فلوریدا (La Florida)، نزدیک شهر کوچک پالاندا (Palanda) در جنوب کشور اکوادور انجام شد. اکوادور در نزدیکی منطقه‌ای واقع شده که کاکائو به‌صورت طبیعی در آن رشد می‌کرد؛ یعنی در ناحیه‌ی شمال‌غربی آمازون.

با این حال، قدیمی‌ترین استفاده از کاکائوی کشت‌شده در جنوب مکزیک و در منطقه‌ی سوکونوسکو (Soconusco) یافت شده است، جایی که قوم موکایا (Mokaya) زندگی می‌کردند. در این منطقه، بقایای ظروف سفالی حاوی آثار کاکائو کشف شده که به حدود ۲۰۰۰ سال پیش از میلاد بازمی‌گردد.