بیشتر مردم دلیلی برای اجتناب از غذاهای حاوی گلوتن ندارند. هیچ مدرک علمی‌ای وجود ندارد که رژیم غذایی بدون گلوتن تأثیر مثبتی بر افراد سالم داشته باشد. برعکس، غلات کامل که حاوی گلوتن هستند، منبع خوبی از فیبر، ویتامین‌ها و مواد معدنی هستند. غلات سبوس دار باعث کاهش قابل توجه خطر ابتلا به دیابت نوع 2 و بیماری‌های قلبی می‌شود و در طولانی مدت باعث تاثیرات مثبت در وزن افراد می‌گردد. با توجه به اینکه محصولات بدون گلوتن اغلب با غلات تصفیه شده ساخته می‌شوند، بنابراین مواد مغذی کمتری دارند و مصرف این محصولات بایستی تحت نظر یک پزشک یا متخصص تغذیه باشد. رژیم‌های بدون گلوتن در دراز مدت ممکن است باعث کمبود فیبر، آهن، نیاسین، تیامین، کلسیم، ویتامین B12، فسفر و روی در بدن گردد.

با این حال، برای بخش کوچکی از جمعیت، یعنی افرادی که دچار اختلالات مرتبط با گلوتن هستند، پیروی از یک رژیم غذایی بدون گلوتن توصیه می‌شود. این مورد برای افراد مبتلا به بیماری سلیاک که یک بیماری خود ایمنی ژنتیکی است که در آن روده کوچک با مصرف گلوتن ملتهب می‌شود، ضروری است.  بین 0.5 تا 1 درصد از جمعیت جهان غرب به این بیماری مبتلا هستند.

علاوه بر مبتلایان به سلیاک و افرادی که از آلرژی گندم رنج می برند، اخیراً نشان داده شده است که بخش کوچک دیگری از جمعیت ممکن است پس از مصرف محصولات مبتنی بر گندم مشکلاتی را تجربه کنند. چنین افرادی مبتلا به بیماری سلیاک یا آلرژی به گندم تشخیص داده نمی شوند. محققان این بیماری تازه پدید آمده را "حساسیت به گلوتن غیر سلیاک" می نامند و تخمین می زنند که حدود 5٪ تا 10٪ از جمعیت جهان از آن رنج می برند. با این حال، اطلاعات کمی در مورد این بیماری وجود دارد. بسیاری از جنبه ها مانند علل دقیق که آیا واقعا گلوتن در ایجاد این بیمای تاثیر گذار است یا خیر و همچنین مکانیسم اثر گلوتن فعلا ناشناخته است.